HMMER，是用于寻找蛋白质序列的同源序列数据库。它使用马尔可夫概率模型的方法。HMMER的目的是更准确的探测到远程同源序列。HMMER正致力于提供给尽可能多的科学家使用本软件。为了使软件更容易获得广泛的使用，HMMER允许通过网络进行交互序列搜索。HMMER官网地址及相关网址资源如下：

• HMMER官网
  http://hmmer.janelia.org/