北京大学深圳医院原名“深圳市中心医院”，是深圳市政府投资4.5亿元人民币建成的现代化综合性三级甲等医院。医院于1999年底建成开业，2001年9月，深圳市政府与北京大学合作，医院更名为“北京大学深圳医院”和“北京大学深圳临床医学院”，纳入北京大学附属医院管理体系。医院占地面积6.7万平方米，建筑面积9.0万平方米，编制病床800张，实际开放病床925张。医院总资产9.3亿元，拥有总价值超3.0亿元的现代化医疗设备。
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